Fethiye Camii, 2018–2022 yılları arasında Vakıflar Genel Müdürlüğü işvericiliğinde, Pekerler İnşaat tarafından restore edilmiştir. Restorasyon kapsamında yapının cepheleri, iç mekânı ve kubbe sistemi özgün dokusuna uygun şekilde onarılmış; mimari, statik ve estetik bütünlüğü korunarak yapı güçlendirilmiştir.